仕訳出力を片側に変更したところ、出力されない項目があります。

仕訳出力を「両側」で登録後に「片側」へ変更した場合、共通項目に設定されている「編集要領」が削除されるため、項目が出力されません。
仕訳出力を「片側」へ変更した際は、お客さまにて「編集要領」の再設定をおこなってください。